Un ancien agent du FBI, Shawn Henry, enquête sur l'aviatrice Amelia Earhart, connue pour être la première femme à avoir traversé l'océan Atlantique en avion, et qui a disparu dans la région de l'archipel des îles Phœnix en 1937. Un cliché montre l'aviatrice et le navigateur Fred Noonan vivants alors qu'ils étaient portés disparus, apportant la preuve qu'ils ont été capturés par l'armée japonaise.